Berdirinya SMPN 3 Pelepat Ilir ini dilatarbelakangi dengan telah ditempatkannya warga transmigrasi dari Pulau Jawa dan warga transmigrasi lokal di Satuan Kelompok Pemukiman (SKP) VII-B yang mencakup Desa Kuamang Jaya, Bangun Harjo, Karya Harapan Mukti dan Kuning Gading yang pada masing-masing desa telah Sekolah Dasar (SD). Atas usulan dari masyarakat kepada Kepala Sekolah Dasar dan Kepala Unit Pemukiman Transmigrasi (Ka. UPT), guna kelanjutan pendidikan anak-anak yang telah lulus Sekolah Dasar, maka pada hari Sabtu tanggal 21 Juni 1986 diadakan musyawarah yang dihadiri oleh Ka. UPT, Kepala Desa, Kepala Sekolah Dasar dan Pemuka Masyarakat di lingkungan SKP VII-B sebanyak 35 orang yang menghasilkan ketetapan :
- Mendirikan atau membuka SMP persiapan dan memanfaatkan gedung SMP milik Departemen Transmigrasi sebagai sarana pendidikan.
- Memilih para pengurus dan personil SMP dengan susunan :
1. Ketua Pendiri/Pembina : NAJIBAR NAINGGOLAN
2. Wakil Ketua : R. ISKANDAR (Ka. UPT Unit XVIII)
3. Sekretaris : SUNOTO (Pemuka Masyarakat)
4. Bendahara : SUYOTO (Kepala SD Unit XVIII)
5. Pembantu Umum : a. DARMADI (Ka. Desa Unit XVI)
b. SUMADI HP (Ka. Desa Unit XVII)
c. S. MANGUNSWARNO (Ka. Desa Unit XVII)
d. M. TOHA (Ka. Desa Unit XIX)
6. Pjs. Kepala Sekolah : K. SINULINGGA, BSc
7. Wakil Kepala Sekolah : SUYOTO
8. Tata Usaha : a. TITIK SRININGSIH, b. RISTON RUMAPEA
9. Tenaga Pengajar : Disesuaikan dengan kebutuhan
Sekolah Menengah Pertama (SMP) Negeri 3 Pelepat Ilir ini resmi dinegerikan oleh Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia dengan Surat Keputusan Nomor 052/0/1988.
SMPN 3 Pelepat Ilir terletak di Desa Kuning Gading Kecamatan Pelepat Ilir Kabupaten Bungo pada areal tanah seluas 19.980 m2. Posisi ini sangat strategis karena Desa Kuning Gading dilalui jalan lintas Kuamang Kuning – Muara Bungo dan berada di tengah-tengah empat desa, sehingga siswanya selain dari Desa Kuning Gading juga banyak berasal dari empat desa tersebut.
Kemudian batas-batas lokasi sekolah ini adalah sebagai berikut :
1. Sebelah Utara : Berbatasan dengan SMKN 1 Pelepat Ilir
2. Sebelah Selatan : Berbatasan dengan jalan Senamat
3. Sebelah Timur : Berbatasan dengan lapangan sepak bola
4. Sebelah Barat : Berbatasan dengan jalan Koto Jayo